Etude De Mode De Liaison De Guanosine Diphosphate Et Guanosine Triphosphate Avec L’arf1, Protéine Impliquée Dans Le Cancer Du Sein, En Présence Et En Absence De Mg2+
Résumé: L’ADP ribosylation factor1 (Arf1) est une petite protéine G localisée au niveau de l’appareil de Golgi où elle exerce plusieurs fonctions homéostatiques comme le transport vésiculaire. Contrairement aux autres membres de cette famille de petites protéines G, Arf1 est surexprimée dans les cellules invasives du cancer du sein et elle est impliquée dans la migration et la prolifération des cellules cancéreuses. Ainsi, Arf1 constitue une cible potentielle dans le traitement anti-cancer du sein. L’objectif principal de notre travail est d’étudier le mode de liaison des deux ligands, GTP et GDP, avec les résidus du site de liaison de l’Arf1 en présence et en absence de l’ion Mg2+. Cette étude est réalisée à l’aide d’une technique de la modélisation moléculaire basée sur la cible biologique, en l’occurrence le docking moléculaire. Les résultats de la présente étude, qui sont en parfait accord avec les résultats de la littérature, montrent que l’ion Mg2+ favorise l’interaction des ligands GTP et GDP aux résidus tapissant le site actif de la protéine en particulier ASP93, ASP96 et THR31. Nous pouvons dire que cette étude constitue un outil potentiel dans la compréhension du mécanisme d’activation et d’inactivation de la protéine Arf1
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