Analyse De Données De Séquençage De Gènes Par Les Outils De Bioinformatique
Résumé: Les banques de données bioinformatiques offrent une grande quantité d’informations sur les génomes, les protéines etles références bibliographiques. Ainsi, elles offrent des outils divers qui facilitent l’ajout, la mise à jour et la recherche des données. L’objectif de ce travail était d’explorer les différentes bases de données, afin de caractériser et cribler des mutations géniques chez E. coli. Nos résultats de la recherche de mutations dans le gène gyrA en utilisant les outils de traduction, de nettoyage de séquences, d’alignement simple et multiple et de BLAST, ont montré pour les deux souches d’E. coli étudiées la présence de deux mutations (S 83 L) et (D 87 N) responsables de la résistance aux quinolones. Concernant le gène gyrB, aucune mutation n’a été caractérisée sur ce gène chez les deux souches étudiées. L’analyse de séquences par les divers moyens offerts dans les milliers de bases de données, permet de s’informer sur les caractéristiques fonctionnelles, structurales et évolutives d’une protéine.
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