Caractérisation Anthropogénétique D'un Échantillon De La Population Algérienne : Analyse Des Marqueurs Parentaux

Résumé: Grâce à leur position stratégique dans le bassin méditerranéen, les populations du Maghreb ont fait l'objet de plusieurs études qui témoignent de la complexité de leur structure génétique. La caractérisation génétique de ces populations a été effectuée par de nombreux marqueurs génétiques dont l'ADN mitochondrial (ADNmt) et le chromosome Y qui permettent de déterminer les origines géographiques des populations ancestrales et la composition révélée par le taux de métissage. Des influences eurasiatiques datant du Paléolithique et du Néolithique et de récentes contributions de l'Afrique subsaharienne et de l'Europe méditerranéenne ont été, ainsi, démontré. Cependant, ce scénario génétique est investi avec un écart notable, qui est le manque d'informations consistantes pour l'Algérie, le plus grand pays du Maghreb. La présente étude décrit la distribution de ces marqueurs uniparentaux et des microsatellites STR du chromosome X dans un échantillon de la population urbaine nord-ouest algérienne (n>200). L'analyse de 21 marqueurs X-STR a été réalisée par PCR multiplex. Les séquences de la région HVSI de l'ADNmt obtenues ont été comparées avec la séquence de référence rCRS (Revised Cambridge Sequence Reference) afin d'identifier les polymorphismes caractérisant les haplogroupes. Pour approfondir cette détermination nous avons analysé les polymorphismes RFLP et SNP, par PCR-RFLP et par miniséquençage SNapShot, respectivement. Concernant l'analyse du chromosome Y, nous avons affiné les résultats, d'une étude précédente dans notre population, par séquençage et détection de 12 polymorphismes SNP déterminant des sous-groupes des haplogroupes E et R, très répandus en Afrique du Nord et en Europe, respectivement. L'analyse statistique des résultats a été réalisée par les logiciels Arlequin (pour le calcul de l'indice de fixation FST, la diversité génétique (h) et pour l'analyse de la variance moléculaire AMOVA), Network et Phylip (pour la réalisation des arbres phylogénétiques), SPSS (pour la réalisation des analyses en composant principal ACP). L'évaluation de la distance génétique sur la base des haplotypes X-STR indique que les Algériens sont proches génétiquement des populations eurasiatiques mais restent assez éloignés des populations de l'Afrique subsaharienne. L'analyse de l'ADN mitochondrial a permis de définir plus de 40 haplogroupes majeurs dont la plus forte fréquence a été observé pour les haplogroupes d'origine eurasiatique : H/HV M1, U6a (30.83%, 7.08%, 6.67%, respectivement. En effet, le composant eurasiatique en Algérie a atteint plus de 80 % pour les deux marqueurs uniparentaux et se traduit par des fréquences élevées (70 %) des haplogroupes du chromosome Y : E-M81 et E-V65. La présence inattendue des dérivées de l'haplogroupe R européen du chromosome Y: R-M412, R-S116, R-U152 et R-M529 en Algérie et le reste du Maghreb semblent constituer les contreparties des sous-groupes de l'ADNmt H1, H3 et HV0. Ceci traduirait les contacts maritimes entre les côtes européennes et nord-africaines de l'ouest de la Méditerranée. Malgré les asymétries sexuelles observées, les profils génétiques uniparentaux des Algériens corrèlent fidèlement entre eux et correspondent parfaitement aux gradients de fréquence des haplogroupes est-ouest et nord-sud observés au nord de l'Afrique. Les résultats de l'analyse du chromosome X sont en accord avec ceux des marqueurs uniparentaux qui estime la contribution féminine et masculine subsaharienne à 20 et 10%, respectivement. Finalement, cette étude devrait être étendue à d'autres échantillons de population, notamment des ethnies berbères, nombreuses sur le grand territoire national Algérien, et d'avoir plus de données sur plus de marqueurs de différents loci. C'est bien l'étude de différents marqueurs génétiques croisés à des éléments archéologiques, linguistiques, ethnologiques et démographiques qui permettront d'obtenir une meilleure compréhension de l'histoire des populations d'Algérie et de leurs relations avec d'autres populations nord africaines, eurasiatiques et subsahariennes.

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