Isolement Et Identification Génotypique Des Rhizobactéries Associées Aux Légumineuses De Sols Miniers. Résistance Aux Métaux Lourds Et Séquençage Des Gènes De Résistance

Résumé: Le but de ce travail est d'identifier et de caractériser les souches isolées à partir des nodules racinaires de quatre plantes de la légumineuse Trifolium sp. récoltées de la mine de Djedada Pb-Zn situé à Hammam N’Bail dans la région de Guelma. Cinquante microorganismes sont isolés, identifiés et criblés in vitro pour leur activité PGPR, ainsi que leur capacité à tolérer des concentrations élevées en métaux lourds et en NaCl. La phylogénie des séquences du gène de l'ARNr 16S révèle une grande diversité des endophytes. Les isolats identifiés appartiennent aux treize genres suivants : Cupriavidus, Pseudomonas, Bacillus, Acinetobacter, Enterobacter, Roseomonas, Paracoccus, Frondihabitans, Microbacterium, Kocuria, Providencia, Micrococcus et Staphylococcus. En ce qui concerne les rhizobia, seuls des isolats affiliés au genre Rhizobium sont obtenus. La présence du gène de nodulation nodC et du gène de fixation d'azote nifH montre que les isolats de Rhizobium appartiennent au symbiovar trifolii. En plus des bactéries, une levure est isolée et identifiée comme Rhodotorula mucilaginosa par séquençage de la région ITS (Internal Transcribed Spacer). Les résultats montrent également que dans l'ensemble, les isolats ont la capacité à produire de multiples traits PGPR importants, avec une capacité remarquable à se développer à une concentration de NaCl allant jusqu'à 20% et sont également résistantes à des concentrations élevés en métaux lourds jusqu'à 1300 μg/ml de Pb ++, 1200 μg/ml de Zn++ , 1000 μg/ml de Ni++, 1000 μg/ml de Cd ++, 500 μg/ml de Cu++, 400 μg/ml de Co++ et 50 μg/ml de CrVI+ . L'ordre de résistance des isolats aux métaux lourds est : Pb++ > Zn++ > Ni++ > Cd++ > Cu++ > Co++ > Cr VI+ . L'existence des gènes czcD et nccA responsables de la résistance au zinc, cadmium, cobalt et nickel respectivement est détectée seulement chez l'isolat Cupriavidus paucula RSCup01.

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