Caractérisation Phénotypique Et Génotypique D'erwinia Sp Pathogène Et Essaie De Lutte Biologique
2019
Thèse de Doctorat
Biologie

Université Ahmed Ben Bella - Oran 1

N
Non Identifié

Résumé: La présente étude a pour objectif principal est l'élaboration d'une stratégie de lutte intégrée contre la maladie du feu bactérien provoqué par la bactérie Erwinia amylovora. et contre la pourriture molle de la pomme de terre provoque par Erwinia carrotovora. Des essais de confrontation in vitro directe et indirecte entre les deux espèces pathogènes d'Erwinia et des bactéries isolées à partir de différents sols rhizosphériques de la région ouest d'Algérie. Les deux genres de bactéries antagonistes utilisée dans ce travail (Serratia plymuthica et Pseudomonas fluorescence) ont montré une activité antimicrobienne contre le pathogène (E. amylovora et carrotovora) par la méthode de confrontation directe par des colonies et par utilisation des surnageant. Les zones d'inhibition varient d'une bactérie à une autre, la plus grande zone d'inhibition est celle obtenue par méthode de surnageant. -Une étude macroscopique et microscopique nous a permis de caractériser les différents isolats obtenus. Les colonies obtenues sont de tailles différentes. L'identification des isolats par la galerie API20E (Biomerieux) et API20NE (Biomerieux), nous a permis d'obtenir des codes qui correspondent à différentes espèces bactériennes (Serratia plymuthica et Pseudomonas fluorescence), ainsi une étude par galerie API-50 CH (Biomerieux) a montré une ressemblance entre les deux types de colonies de Serratia Plymuthica, ainsi une différence entre les souches de Pseudomonas fluorescence et cela dans la dégradation des différents sucres. Un test du pouvoir pathogène des isolats a été réalisé sur une plante indicatrice et qui nous a confirmé la pathogénicité de nos souches isoles (Erwinia amylovora et Erwinia carotovora). Une identification moléculaire a été utilisée pour bien confirmer le type de la souche. Une étude comparative de la sensibilité des différentes variétés de pomme de terre a été effectuée et nous a permet d'identifier la variété la plus sensible parmi les cinq utilisés ou la variété désirée semble d'être la plus résistante par rapport aux autres variétés et cela contre maladie de pourriture molle. Une étude in vivo sur les fruits immatures de poirier a montré une diminution de la progression du pathogène, avec une variation de l'indice d'infection d'une souche antagoniste par rapport à l'autre, ainsi, une étude sur tranche de pomme de terre a montré une inhibition de la maladie de pourriture molle par les souches antagonistes de Serratia plymuthica.

Mots-clès:

feu bactérien
pourriture molle
solanum tuberosum
antagoniste
serratia plymuthica
pseudomonas fluorescence
erwinia amylovora
erwinia carotovora
lutte biologique
in vitro
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