Caractérisation Moléculaire Des Bactéries Impliquées Dans La Biodégradation Des Hydrocarbures

Résumé: Les produits pétroliers, du fait de leur utilisation massive, constituent des polluants importants des aquifères et des sols. Le devenir de ces polluants rejetés dans l’environnement est principalement gouverné par les processus de biodégradation. L’existence de ces phénomènes dépend de la biodégradabilité intrinsèque du polluant mais aussi de la présence de microflores dégradatrices compétentes dans les eaux souterraines et dans les sols. Au cours de ce travail, nous avons développé une méthodologie permettant d’évaluer la biodégradabilité des hydrocarbures pétroliers en conditions aérobies. Elle consiste à mesurer, par méthodes analytiques telles: Chromatographie en Phase Gazeuse (CPG) et Chromatographie sur Couche Mince (CCM) couplées à un Détecteur à Flamme d’Ionisation (FID), après incubation dans des conditions optimales, la consommation de chacun des hydrocarbures présents dans différentes fractions du pétrole (saturés et aromatiques). En utilisant une méthode de séquençage des gènes codant l’ADNr 16S, les compositions en micro-organismes des bactéries adaptées au sol contaminé par les hydrocarbures ont été déterminées. Des arbres phylogénétiques ont été élaborés. Les capacités de dégradation des bactéries sélectionnées et la présence ou non de gènes fonctionnels de dégradation codant pour l’oxydation initiale des hydrocarbures (alkB, nahAc, nidA) ont été étudiées. Les résultats indiquent que le groupe Gamma-Protéobactéries était le principal acteur de cette dégradation. Pseudomonas sp. groupe bactérien majoritaire spécifique adapté à la pollution aux hydrocarbures à la capacité de métaboliser (en culture simple) certains hydrocarbures récalcitrants (alcanes ramifiés tel le Pristane (n-C19) à 35.11% et les aromatiques lourds tels le Benzo[a]Pyrène (n-C20) à 33.93% et de cométaboliser (en consortium) les différentes fractions du pétrole brut à 50.44% pour les saturés et à 30.42% pour les aromatiques polycycliques. L’efficacité de la biodégradation des microflores est liée à la présence de voies métaboliques particulières chez certains micro-organismes et à la coopération entre les différents micro-organismes composant les microflores. Ces bactéries hydrocarbonoclastes peuvent être utilisées pour concevoir des cultures mixtes (consortium) avec des capacités de biodégradation spécifiques pour les différentes fractions pétrolières dans les traitements des stations d’épuration.

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