Analyse Biochimiques De Composés Bioactifs D'origine Microbiènne Impliqués En Biorédiation

Résumé: L'étude décrit les principaux traitements microbiologiques, préventifs et de réhabilitation, susceptibles d'intervenir dans la lutte contre les pollutions qui peuvent affecter l'environnement. Elle met en évidence des exemples de traitement des principales sources de pollution par voie microbiologique qui permettent d'améliorer l'atténuation naturelle. Dans ce contexte, 10 bactéries dégradant les hydrocarbures ont été isolées d'enrichissements obtenus à partir de sites contaminés par des hydrocarbures totaux et divers polluants industriels. Ce travail a été suivi par l'élaboration d'une application en laboratoire qui à consisté à utiliser ces micro-organismes dans le cadre d'une station pilote de bioremédiation d'effluents industriels issus de la raffinerie d'Arzew-Oran. Les souches isolées se sont avérées particulièrement efficaces dans la purification des polluants pétroliers, avec une diminution de 140 ppm à 0 ppm d'hydrocarbures totaux après traitement biologique. Afin de mettre en évidence les liens de parentés entre nos isolats et des souches existantes, l'étude a été approfondie par une analyse phylogénomique reposant sur l'analyse de la séquence des gènes codant pour l'ARNr 16S et l'analyse complète du génome, permettant d'identifier les souches comme appartenant aux genres Enterobacter, Serratia et Citrobacter. L'analyse bioinformatique des génomes a par ailleurs permis d'identifier des génes d'intéret conférant aux isolats la capacité d'exercer un rôle dans l'élimination naturelle des polluants. Nous avons investigué la production de biosurfactants par deux espèces bactériennes Stenotrophomonas pavanii 1800 et Bacillus velezensis E1J dans différentes conditions de culture, incluant des milieux riches et minimums ainsi qu'avec différentes sources de carbone. Des études MALDI-TOF-MS, ont révélé que les biosurfactants produits par S. pavanii 1800 sont des rhamnolipides comprenant des congénères mono et di rhamnolipides et aussi la présence d'autres biosurfactants identifiés comme étant des surfactines, fengycines et iturins qui ont été produits par la souche B. velezensis E1J. Des micro-organismes croissant sur les hydrocarbures sécrètent des biosurfactants et des bioémulsifiants, ce qui facilite l'utilisation des substrats hydrophobes. Cependant, l'isolement de bactéries produisant des biosurfactants lors de la croissance sur des hydrocarbures pétroliers totaux représente un aspect nouveau par rapport aux travaux déjà publiés. Une meilleure compréhension des mécanismes microbiens responsables de la dégradation des polluants pétroliers étant essentielle à l'amélioration des bi-traitements, les résultats obtenus contribuent à faire avancer les connaissances dans le domaine.

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