Implication D’un Facteur De Transcription Bhlh Dans La Réponse Au Stress Salin Chez Medicago Ciliaris : Une Étude Préliminaire

Résumé: Les stress abiotiques tels que le stress salin représentent un défi majeur pour l’agriculture mondiale. L’identification des marqueurs moléculaires permettant de mieux appréhender les mécanismes de tolérance à ces stress constitue un axe de recherche majeur depuis plusieurs années. Parmi ces marqueurs moléculaires, les facteurs de transcription bHLH sont parmi les plus impliqués dans la résistance au stress salin chez les plantes en général et chez les légumineuses du genre Medicago en particulier. Le but de notre étude était de mettre au point la réaction PCR avec un couple d'amorces spécifique du gène codant le facteur de transcription bHLH106 chez deux espèces du genre Medicago : M. ciliaris et M. truncatula utilisée comme témoin car ces amorces ont été synthétisées à partir du génome de cette espèce. L’amplification par PCR a été réalisé à partir de la séquence de génome de medicago trancatula extrait par la technique au CTAB/chloroforme/isoamyl. L’intégrité des ADN a été évaluée par électrophorèse sur gel d’agarose et la concentration et la pureté par un spectrophotomètre de type Nanodrop. Les résultats de l’amplification ont montré dans un premier temps la présence de bandes non spécifiques pour les deux espèces avec une température d’hybridation de 51°C. Dans un second temps une température d’hybridation de 53°C a permis d’obtenir la présence d’une bande unique pour les deux espèces. Néanmoins la taille du fragment amplifié chez M. truncatula est différente de celle prévue par les bases des données d’une part et de celle observée chez M. ciliaris d’autre part. Ces mêmes amorces devront être par la suite testées sur des cDNA afin de confirmer ou d’infirmer cette différence entre les deux espèces. Ces résultats montrent l’importance de tester les amorces par la technique PCR classique sur ADN génomique avant de les utiliser par la technique RT-PCR dont le but sera d’étudier l’expression du gène bHLH106 au niveau transcriptionnel en condition de stress.

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