Développement Et Implémentation D’un Solveur Bio-inspiré Pour L’alignement De Séquences Biologiques
Résumé: La bioinformatique est une discipline qui vise le traitement automatique de l’information biologique. L’alignement multiple de séquences (MSA) constitue une tâche fondamentale pour beaucoup d’applications en bioinformatique. Dans ce mémoire de fin d’étude, nous avons développé et implémenté un solveur bioinspiré basé sur deux algorithmes métaheuristiques à population : la méthode d’optimisation par essaim de particules et les algorithmes génétiques pour la résolution du problème MSA. L’application développée opère sur un ensemble d’alignements dont l’évolution est assurée par des opérateurs appropriés de chaque algorithme et l’obtention d’un ensemble d’alignements de bonne qualité après un certain nombre d’itérations.
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