Revue Bibliographie Des Méthodes Moléculaires Actuelles Utilisées Pour L’étude Des Souches De Bnl Associées Aux Différents Genres De La Famille Des Fabaceae

Résumé: présent travail consiste à passer en revue les différentes techniques moléculaires utilisées, actuellement, a travers le monde, pour l‟étude de la diversité moléculaires des Bactéries Nodulant les Légumineuses (BNL) associées aux différentes espèces et genre de la famille de Fabaceae. Dans ce travail bibliographique, nous avons passé en revue l‟évolution des techniques moléculaires durant cette dernière décennie, qui ont fait ressortir que la technique „‟ Multi Locus Sequence Analysis (MLSA) „‟ semble être la plus utilisée et la mieux appropriée, aussi pour des considérations économiques. Cette technique se basant sur la phylogénie des gènes ARN 16S et des gènes de ménages s‟est révélée la mieux appropriée vu la précision qu‟elle donne sur la position taxonomique des BNL, et par conséquent, la plus utilisée. Après analyse critique de l‟évolution (2009 à 2021) de l‟utilisation des techniques moléculaire à travers le monde, ce modeste travail a permis de mettre le point sur l‟importance du marqueur ARN16S dans la détermination des genres, alors que les gènes de ménage permettent de préciser la position taxonomique au niveau de l‟espèce. En effet, l‟étude de la diversité moléculaire des souches de BNL associées au genre Retama „‟tribu des Genistae’’, dans laquelle, ont été utilisés des marqueurs moléculaire de l'espace inter génique (IGS) du gène de l'ADNr 16S, même associées aux gènes symbiotiques nifH et nodC, n‟a pas permis une différenciation génétique significative des populations de rhizobiums, et donc, seul genre Bradyrizobium a pu être identifié comme BNL associées au genre Retama (tribu des Genistae) dans le nord d‟Algérie. Par ailleurs, selon un autre travail étudiant la diversité moléculaire des souches de BNL isolées des nodosités des racines de différents genres de Fabaceae (Argyrolobium uniflorum, Lotus creticus, Medicagosativa) en Tunisie et (Lotus arabicus) au Sénégal, il s‟avère que le gène ARNr 16S et le gène de nodulation nodA n‟ont pas pu dépasser des clusters du genre Ensifer. Et la position taxonomique (Ensifer meliloti, E. teranguae et E. adhaerens) des espèces n‟a été possible que grâce à l‟hybridation ADN/ADN. Récemment, l‟étude de la diversité moléculaire des souches de BNL associées aux quelques espèces spontanées à „‟tribu des Genistae’’ dans le Sahara d‟Algérie, dans laquelle l‟analyse phylogénétique des séquences du gène de l‟ARNr 16S additionnée des gènes de ménage (recA et atpD) a permis l‟affiliation des souches isolées à l‟échelle espèce, à savoir, E.meliloti LMG6133T, N.Galegae LMG6214T , N.alkalisoli et M. camelthorni CCNWXJ404T (figure 15). De même et en utilisant les même marqueurs (ARN 16S et gènes de ménage recA et atpD) , un travail réalisé en chine a permis d‟identifier une nouvelle souche R.changzhiense WYCCWR 11279T associée à la Fabaceae cultivée Vicia sativa L.

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