Etude Taxonomique Et Diversité Des Bactéries Nodulant Spartium Junceum (l.) De La Région De Béjaia

Résumé: Vingt-trois souches bactériennes ont été isolées à partir de nodules racinaires de Spartium junceum (L.), poussant à l'état sauvage dans quatre sites géographiques différents de la région de Béjaia (Nord-est d'Algérie). Pour clarifier leur position taxonomique et phylogénétique, les souches ont été analysées par une approche polyphasique combinant une caractérisation symbiotique (nodulation, efficacité), des techniques phénotypiques (morphologie, biochimie et physiologie, appuyée par une taxonomie numérique) et des techniques génotypiques (PCR/RFLP de l'ADNr 16S, séquençage du gène codant pour l'ARNr 16S, de deux gènes de ménage codant pour les protéines glnII et recA et d’un gène symbiotique, nodC). Les tests d'infection des plantes ont révélé que toutes les souches étaient capables de former des nodules sur leur plante hôte d'origine, mais avec une capacité de nodulation et une efficacité symbiotique variables. Toutes les souches sont des rhizobia à croissance lente produisant des alcalis dans le milieu YEMA. Selon les résultats des tests phénotypiques, les souches ont été groupées en quatre principaux clusters dans un dendrogramme UPGMA, alors qu'elles ont été discriminées en 12 génotypes distincts par comparaison de leur profil PCR/RFLP de l'ADNr 16S. Les analyses phylogénétiques du gène codant l'ARNr 16S et de deux gènes de ménage concaténés, glnII et recA, ont réparti les souches représentatives en deux clades majeurs au sein du genre Bradyrhizobium. Certaines de ces souches sont étroitement apparentées à B. retamae et B. japonicum, tandis que d'autres pourraient former de nouvelles espèces génomiques. Sur la base de l'analyse de la séquence du gène symbiotique (nodC), la majorité des souches a été placée dans le cluster symbiovar retamae à l'exception de la souche SjBA12 qui pourrait constituer un nouveau symbiovar au sein du genre Bradyrhizobium.

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