Identification Et Caractérisation Des Souches Rhizobiennes Productrices De Substances Antimicrobiennes « Bactériocines »

Résumé: La symbiose légumineuse-rhizobium est l'association bactérienne végétale la plus prometteuse pour l'augmentation du rendement des légumineuses fourragères par la fixation biologique de l'azote. Les Rhizobium sp. ont la capacité de coloniser les nodules racinaires des légumineuses et sont couramment utilisés comme biofertilisants. La compétitivité des souches introduites est un facteur très important dans la performance d'un inoculum qui est basé sur l'utilisation de souches rhizobiennes productrices de bactériocines. Dans le présent travail, nous nous sommes intéressés à la production de substances antimicrobiennes par les rhizobia. Dans cette étude, 30 souches rhizobiennes ont été isolées de nodules de Medicago sativa prélevés du sol salin de la sabkha d’Oran-Misserghin. Les trente isolats présentent une morphologie comparable à celle des rhizobia connus. Le test de nodulation in vitro en conditions contrôlées a confirmé l’infectivité des isolats vis-à-vis de leur plante hôte. Les vingt isolats les plus efficients ont été retenus pour les tests physiologiques et antagoniques. Les souches isolées se distinguent par leur tolérance à la salinité, à des pH allant de 5 à 12 et à des températures extrêmes comprises entre 10°C et 45°C. La capacité des souches à solubiliser le phosphore est déterminée uniquement pour la souche SW16, alors que deux (SW15 et SW9) souches ont la capacité de produire d’acide- indole- acétique (AIA). La recherche des inhibitions a permis de sélectionner deux souches fortement inhibitrices SW15 et SW16 et une souche indicatrice SW10 pour la production de substance inhibitrice. L’identification moléculaire par amplification PCR de l’ADNr 16S des souches SW15 et SW16 a révélé leur appartenance au genre Ensifer. Après leur concentration, ces substances inhibitrices expriment un effet bactériostatique contre la souche SW10. Leur production est liée à la croissance bactérienne et suit un schéma de production de métabolites primaires. Les deux substances antimicrobiennes sont sensibles aux protéases, thermotolérantes, résistantes à une gamme de pH et insensibles aux agents chimiques. Leurs activités sont plus élevées dans les surnageants de culture, partiellement purifiés. Leurs poids moléculaires indiquent que la souche SW15 présente deux bandes de poids moléculaires différents, alors que la souche SW16 montre une seule bande. L’étude du spectre d’activité des surnageants purifiés vis-à-vis des bactéries et des champignons phytopathogènes a montré une inhibition de tous les microorganismes testés sauf la bactérie Pseudomonas aeruginosa. La co-inoculation de Medicago sativa avec P. aeruginosa associée aux Ensifer meliloti améliore la croissance des plantes et l’efficacité symbiotique par rapport à l'inoculation avec Ensifer meliloti seul.

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