Contribution À La Caractérisation Génétique Des Races Ovines Algériennes, Marocaines Et Françaises Par L'utilisation Du Microsatellite Oarfcb128 Et Étude De Leurs Relations Phylogénétiques

Résumé: Ce travail s'inscrit dans le cadre de l'étude de la biodiversité des ressources génétiques animales en général et des ovins en particulier.L'objectif de cette étude est d'une part, de contribuer à la caractérisation génétique de treize races ovines provenant de trois pays différents méditerranéens : six races algériennes (Ouled-Djellal, Hamra, Rembi, Sidaoun, Taâdmit et D'men), cinq races marocaines (Timahdite, Sardi, Beni Guil, Boujaâd, et D'man) et deux races françaises (Rouge du Roussillon et Mérinos de Rambouillet) par l'analyse de l'ADN de 366 animaux (13 à 30 animaux non apparentés par race) par l'utilisation d'un marqueur de type microsatellite OarFCB128. La méthode utilisée est l'amplification in vitro (PCR) des ADN ovins suivie de l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide non dénaturant et d'une coloration au nitrate d'argent. Après le génotypage des ADN, des analyses statistiques en utilisant différents logiciels ont été réalisées afin d'avoir une première estimation de la variabilité génétique de ces races pour le microsatellite OarFCB128.La variabilité génétique intra-race a été quantifiée par les fréquences alléliques et le taux d'hétérozygotie théorique non biaisé. L'équilibre de Hardy-Weinberg a été vérifié pour les races étudiées dont seulement la race Mérinos de Rambouillet était en équilibre. Un total de 14 allèles a été détecté dont 9 allèles pour les trois races algériennes Taâdmit, Sidaoun et D'men. Un test d'assignation a permis d'affecter 26,66 à 70% des 318 animaux génotypés à leur race d'origine.D'autre part, notre objectif s'est poursuivi par la contribution à l'étude phylogénétique de ces races en utilisant les résultats obtenus en parallèle pour 3 autres microsatellites INRA63, BM1824 et OarCP34. Elle nous a permis d'étudier la variabilité génétique inter-race en utilisant deux indices de distance : la distance standard de Nei (1972) et la distance de Prevosti et collaborateurs (1975). Les matrices de distances génétiques ont permis la construction d'arbres phylogénétiques par les deux méthodes "UPGMA" et "Neighbor-Joining". Les trois races Ouled Djellal, Hamra et Rouge du Roussillon sembleraient, d'après nos résultats, génétiquement proches. L'Analyse Factorielle des Correspondances a confirmé globalement les résultats de l'arbre phylogénétique mais a montré l'isolement de la race Beni Guil des autres races. De plus, la contribution relative de chaque race à la diversité totale a été évaluée.Enfin, nos résultats restent préliminaires car limités à un faible nombre de microsatellites et devraient être approfondies par l'étude d'au moins vingt marqueurs.Les retombées de ce travail à moyen terme seraient de définir une stratégie de conservation et de préservation de nos races ovines algériennes.

Publié dans la revue: